宁夏主要河流有黄河干流及其支流。境内黄河及其各级支流中，流域面积>10000km2者仅黄河和清水河2条，>1000 km2的有15条。祖厉河、清水河、红柳沟、苦水河及黄河两岸诸沟位于黄河上游下段，葫芦河、泾河位于黄河中游中段，另外有黄河流域内流区（盐池）、内陆河区（属内蒙古石羊河的中卫县甘塘）。

    黄河干流自中卫县南长滩入境，流经卫宁灌区到青铜峡水库，出库入青铜峡灌区至石嘴山头道坎以下麻黄沟出境，区内河长397km，占黄河全长5464km的7%。多年平均过境水量306.8亿m3（1956～2000年），是宁夏主要的供水水源。

    祖厉河位于西吉、海原两县境内，区内集水面积597km2，由甘肃省靖远县汇入黄河。

    清水河是我区汇入黄河的最大支流，发源于固原市原州区开城乡黑刺沟脑，集水面积14481km2（区内13511km2；甘肃省境内970km2)；河长320km，左岸支流有东至河、中河、苋麻河、西河、金鸡儿沟、长沙河6条；右岸有双井子沟、折死沟2条。流经原州区、西吉、同心、海原、中卫、中宁6县（市），由中宁县泉眼山汇入黄河。

    红柳沟为直接入黄支流，发源于同心县田老庄乡黑山墩，集水面积1064km2，河长107km，流经同心、中宁两县，由中宁县鸣沙洲汇入黄河。

    苦水河是直接入黄的另一支流，发源于甘肃省环县沙坡子沟脑，集水面积5218km2（区内4942 km2）。由甘肃环县进入我区，经盐池、同心、灵武、利通区四县（市），由灵武市新华桥汇入黄河。

    黄河右岸诸沟主要有中卫县的高崖沟、灵武市的大河子沟及陶乐县的都思兔河，区内集水面积9532km2。黄河左岸诸沟包括卫宁北山南麓与贺兰山东麓各沟，主要有贺兰山东麓的花石沟、苏峪口沟、大水沟、汝箕沟、大武口沟、红果子沟等，区内面积5177km2。

    葫芦河发源于西吉县月亮山，区内面积3281km2,干流在境内长120km。左岸有马连川、唐家河、水洛河等8条支流，右岸有滥泥河。流经我区西吉、固原市原州区、隆德三县后进入甘肃省静宁、庄浪县。

    泾河发源于泾源县六盘山东麓马尾巴梁东南，在我区总面积4955km2，干流在区内长39km，主要支流有暖水河、颉河、洪川河、茹河、蒲河、环江6条。流经泾源、固原市原州区、彭阳、盐池4县（市）后进入甘肃省华亭、平凉、镇原及环县。